کلیسای مریم مقدس مربوط به دوره صفوی است. این اثر در سال ۱۳۸۱ به‌عنوان یکی از آثار ملی ایران به ثبت رسیده است. کلیسای مریم مقدس بعد از کلیسای هاکوپ، دومین کلیسای قدیمی شهر اصفهان است.