گمرک مرزی آستارا به عنوان یک اداره کل در امور واردات و صادرات قطعی، ورود و خروج موقت، ترانزیت داخلی و خارجی، کاپوتاژ، امور مسافری، امانت های پستی و قضایی فعالیت می کند و یکی از قدیمی ترین و فعال ترین واحدهای گمرکی جمهوری اسلامی ایران در شمال کشور و استان گیلان است. وجود دو فاکتور مهم صادرات و واردات کالا از شاخصه های مهم گمرک آستارا است که این مرز را به کانون تردد مسافران داخلی و خارجی و صادرات و واردات کالا به کشور های خارجی همسایه با ایران تبدیل کرده است. در اداره کل گمرک آستارا ۳ قلاده سگ های ویژه مالینویز بلژیکی مواد یاب که هر یک قلاده ۵۰ هزار دلار قیمت دارند، با سه مربی و با هدف مقابله با قاچاق انواع مواد مخدر و بازرسی از محموله های صادراتی، وارداتی، ترانزیت، کشتی های ورودی و خروجی در اسکله بندر آستارا، سالن مسافری گمرک و همچنین در مبادی ورودی و خروجی مرزهای زمینی و ریلی در کنار دستگاه های ایکس ری کامیونی و چمدانی فعال هستند. وجود سگ های فوق عامل بازدارندگی از ورود و خروج مواد مخدر است و در این زمینه برقراری ارتباط مناسب بین سگ و مربی حائز اهمیت بوده و توانسته به موفقیت کشف انواع قاچاق در گمرک مرزی آستارا کمک کند.